Z dosavadních archeologických průzkumů vyplývá, že okolí obce bylo osídleno v mladší a pozdní době kamenné (asi před 5 000 lety). První historická zmínka o Výžerkách je spojena se sousedními Prusicemi a Komorcemi a je z roku 1339. Ze soupisu z roku 1586 je patrné, že zde byl poplužní dvůr, vytvořený větší částí z poddanských gruntů. Přímo v Komorcích byl pivovar se sladovnou a ve Výžerkách ovčín. Obec Výžerky se nachází v údolí čertovy brázdy (vede ze Sázavy na Kouřim), je obklopena převážně jehličnatými lesy. V obci není žádný průmysl, takže obyvatelé musí za prací dojíždět, někteří až do Prahy. Obec je krásná přírodním bohatstvím a vzhledem k tomu, že má i krásnou a udržovanou vodní plochu, slouží širokému okolí jako obec rekreační.